Matthias Werner, geboren in Nordhausen, absolvierte eine Ausbildung zum Innenausstatter mit anschließendem Architekturstudium am Bauhaus Weimar. Von 2000 bis 2006 arbeitete er als Bühnenbildassistent u.a. mit Jan Pappelbaum an der Schaubühne am Lehniner Platz sowie am Theater Nordhausen und am Saarländischen Staatstheater Saarbrücken. Seit 2004 entwirft er eigene Bühnenbilder und Kostüme u.a. am Schauspiel Stuttgart, Maxim Gorki Theater Berlin, Theater an der Wien/ Neue Oper Wien, Schauspielhaus Bochum, Staatstheater Oldenburg, Staatstheater Braunschweig und am Ballhaus Naunynstrasse. Er arbeitete mit Regisseuren zusammen wie Anna Bergmann, Helena Waldmann, Jan Neumann, Hendrik Müller, Neco Celik, Maguerite Donlon, Petra Wüllenweber und Bob Ziegenbalg. Zudem entwirft Matthias Werner Szenenbilder für Film, zuletzt für Das merkwürdige Kätzchen von Ramon Zürcher, der auf der 63. Berlinale 2013 seine Uraufführung hatte.